西元1624年，荷蘭人來到臺灣後，在大員營建熱蘭遮城(Zeelandia)，成為荷蘭在臺灣殖民統治的行政中心與商館所在地。熱蘭遮城周圍，有許多船隻往返，來自中國、日本、東南亞各地的貨物都在此匯集，建構起大員作為東亞重要轉口貿易港的地位。
荷蘭人在沿海的沙洲建立熱蘭遮城作為根據地後，再往臺灣內陸移動，在赤崁地區設立普羅民遮街，用來貿易及取得糧食。郭懷一事件後，荷蘭人為了防範赤崁地區再爆發類似的漢人起事，便修築堡壘防禦，即為「普羅民遮城」，堡壘遺址位於現今的赤崁樓內。
