西元1626年，西班牙艦隊先在三貂角登陸，並進占雞籠港，隨後在社寮島(今基隆和平島)舉行占領儀式。為了防範荷蘭人入侵，西班牙人築聖薩爾瓦多(San Salvador)城，並建有炮臺加強防禦；後來又占領淡水，建聖多明哥(San Domingo)城。之後，西班牙人除了新闢直達雞籠(今基隆)的陸路外，並沿著淡水河各支流招撫各社原住民，宣示統治，形成荷蘭、西班牙分占臺灣南北的態勢。
西班牙人占據臺灣北部的原因，一方面固然是為對抗荷蘭，另一方面亦是要誘致中、日的商賈到臺灣北部，重開已經斷絕的對日貿易，同時又想向中、日兩國傳布其教義。
但西班牙占領臺灣北部之後，中國船隻前來貿易者遠比預期少，而日本國內在西元1633∼1635年之間，逐步厲行鎖國和禁教，斷絕了西班牙對日貿易與傳教的期望。西班牙人因對日貿易受挫，減少駐臺守軍。
