民國76年臺灣解嚴之後，政府開放國人前往中國大陸探親，民間貿易與文化交流日趨頻繁，揭開兩岸交流的序幕。
民國80年，我國政府設立大陸委員會（簡稱陸委會），並委託民間的海峽交流基金會（簡稱海基會）負責對中國大陸事務的協商工作；中華人民共和國則建立海峽兩岸關係協會（簡稱海協會），兩岸的民間交流機制得以展開。
民國90年以來，政府陸續開放小三通、大三通、陸客來臺等，金門、馬祖在兩岸關係中的角色從防衛據點轉為交流通道。
